Arche Nova: Wasserwelten, eine Erweiterung für Arche Nova, führt mehrere neue Elemente in das Spiel ein, wie z.B. Meerestiere, die jeweils in neuen speziellen Gehegen gespielt werden müssen, die in der Nähe von Wasser gebaut werden müssen.
Etwa die Hälfte der Meerestiere sind Riffbewohner, und immer wenn du einen Riffbewohner zu deinem Zoo hinzufügst, löst du die Fähigkeit aller Riffbewohner in deinem Zoo aus. Um die Verdünnung des Decks, die natürlich durch das Hinzufügen weiterer Karten verursacht wird, in den Griff zu bekommen, haben alle Meereskarten ein Wellensymbol, und immer wenn es in der Auslage aufgedeckt wird, wirfst du die erste Karte in der Reihe ab und füllst sie dann wieder auf.
Eine neue vierte Universität ist auf der Vereinstafel verfügbar, und wenn du sie nimmst, beanspruchst du eine von sechs Spezialuniversitäten aus der Reserve, die ein Forschungssymbol und eines von sechs Tiersymbolen aufweisen. Wenn du dieses Amt übernimmst, deckst du Karten vom oberen Rand des Stapels auf und behältst die erste aufgedeckte Karte mit einem Tiersymbol, das zu deiner gewählten Universität passt.
Für jede der fünf Aktionskarten werden vier alternative Versionen mit einer kleinen Abwandlung verfügbar sein. Die Spieler ziehen zu Beginn des Spiels Aktionskarten und ersetzen zwei ihrer Standard-Aktionskarten durch diese neuen Karten, um die Asymmetrie im Spiel zu erhöhen.
Neue Bonusplättchen und Karten für die Schlusswertung werden ebenfalls enthalten sein.
Außerdem wird die Erweiterung alternative Holzmarker für die 3 Strecken und niedliche Tiere enthalten, mit denen du die von dir unterstützten Naturschutzprojekte markieren kannst, anstatt deine normalen Spielermarker zu verwenden.