Neue Inseln sind aus dem Ozean aufgetaucht, und als Wissenschaftler musst du die neuen, sich entwickelnden Ökosysteme dort erforschen. Beobachte, wie die Inseln auf dem Spielbrett in drei Dimensionen wachsen, während du mehr über sie erlernen kannst, und füge jeder Insel bunte Pflanzen und Tiere hinzu, während du ihre Ökosysteme erforschst.
In jeder Runde von Emerge verdienst du Punkte, indem du würfelst und sie einsetzt, um Forschungen zu sammeln und Entdeckungen zu machen. Alle Spieler beginnen mit demselben Forschungsbrett, aber im Laufe des Spiels kannst du dein eigenes Brett verändern und deine Forschungen anpassen. Nach acht Runden erhältst du Punkte dafür, wie gut deine Inseln gedeihen und wie artenreich sie sind.